Hướng dẫn nộp thuế điện tử cho shop online năm 2026

Từ năm 2026, các cá nhân và hộ kinh doanh online bắt buộc thực hiện nộp thuế điện tử cho shop online nhằm minh bạch hóa doanh thu trên các nền tảng số và sàn thương mại điện tử (TMĐT). Tuy nhiên, nhiều người nộp thuế gặp khó khăn trong thao tác trên hệ thống eTax hoặc phân định nghĩa vụ thuế giữa các kênh bán hàng, dễ dẫn đến rủi ro bị xử phạt.

Nội dung chính của bài viết:

• Cá nhân/hộ kinh doanh bán hàng online có doanh thu trên 500 triệu đồng/năm phải kê khai và nộp thuế. Sàn TMĐT sẽ trích thuế nộp thay nhưng bán qua mạng xã hội/website phải tự thực hiện nghĩa vụ thuế.

• Nộp thuế qua eTax Mobile thực hiện theo các bước như đăng nhập, liên kết ngân hàng, chọn khoản thuế và xác nhận thanh toán. Người nộp thuế cần lập tờ khai trước trên Dịch vụ công Thuế nếu ứng dụng chưa hỗ trợ.

• NNT cần tuân thủ thời hạn nộp thuế, kiểm tra kỹ tờ khai và đồng bộ doanh thu đa kênh để tránh sai sót, bị phạt.

1. Đối tượng bắt buộc đăng ký thuế khi bán hàng online

Theo Nghị định 68/2026/NĐ-CP, cá nhân kinh doanh (CNKD) và hộ kinh doanh (HKD) có doanh thu từ hoạt động bán hàng online trong năm dương lịch từ 500 triệu đồng trở lên là đối tượng bắt buộc phải kê khai và nộp thuế giá trị gia tăng (GTGT), thuế thu nhập cá nhân (TNCN).

Việc đăng ký thuế phải được thực hiện trong thời hạn 10 ngày làm việc kể từ ngày bắt đầu hoạt động kinh doanh để được cấp mã số thuế và hướng dẫn phương pháp kê khai phù hợp.

Cá nhân kinh doanh/hộ kinh doanh online đạt doanh thu từ 500 triệu đồng trở lên bắt buộc kê khai và nộp thuế (Nguồn: Internet)

Tuy nhiên, hình thức khai và nộp thuế sẽ có sự khác biệt rõ rệt dựa trên việc người nộp thuế (NNT) bán hàng trực tiếp trên các nền tảng mạng xã hội hoặc thông qua các sàn TMĐT, cụ thể như sau:

• Nghĩa vụ thuế trên các sàn TMĐT: Từ năm 2025, sàn TMĐT có chức năng đặt hàng trực tuyến sẽ kê khai, nộp thuế thay cho CNKD, đồng thời cung cấp dữ liệu doanh thu trực tiếp cho cơ quan thuế. NNT cần đối soát với sàn để đảm bảo chính xác và tự kê khai phần thu nhập ngoài sàn (nếu có).

• Nghĩa vụ thuế trên các nền tảng số khác: Do các nền tảng này không có chức năng thanh toán/đặt hàng tập trung hoặc không thuộc đối tượng nộp thay, NNT phải tự thực hiện toàn bộ quy trình (đăng ký thuế, kê khai doanh thu, nộp tiền thuế vào ngân sách nhà nước theo định kỳ). Cơ quan thuế sẽ giám sát dựa trên dữ liệu từ các đơn vị vận chuyển và dòng tiền ngân hàng của NNT.

Nghĩa vụ thuế trên nền tảng số và sàn TMĐT có sự khác biệt (Nguồn: Internet)

2. Hướng dẫn nộp thuế điện tử cho shop online

Để nộp thuế đơn giản và thuận tiện, NNT có thể thực hiện nộp thuế nhanh chóng cho shop online qua ứng dụng eTax Mobile theo các bước sau:

Bước 1: Đăng nhập ứng dụng eTax Mobile

NNT truy cập vào ứng dụng eTax Mobile, sử dụng mã số thuế và mật khẩu đã được cơ quan thuế cấp để đăng nhập.

Trường hợp chưa có tài khoản, NNT chọn “Đăng ký ngay” và thực hiện theo hướng dẫn của hệ thống để tạo tài khoản mới.

Bước 2: Liên kết tài khoản ngân hàng

Tại giao diện chính, NNT chọn mục "Liên kết/Hủy liên kết ngân hàng", chọn ngân hàng đang sử dụng và thực hiện theo hướng dẫn để kết nối tài khoản.

Bước 3: Nộp thuế

NNT chọn mục “Nộp thuế”, các khoản thuế cần nộp sẽ hiện trên màn hình bao gồm loại thuế, kỳ tính thuế và số tiền cụ thể. NNT kiểm tra kỹ thông tin, chọn khoản thuế muốn thanh toán, xác nhận bằng mã OTP từ ngân hàng để hoàn tất giao dịch.

Lưu ý: 

• Do eTax Mobile hiện chưa hỗ trợ trực tiếp mẫu tờ khai 02/CNKD-TMĐT cho CNKD/HKD online, NNT cần chủ động lập tờ khai này trên Cổng Dịch vụ công Thuế điện tử trước khi vào ứng dụng để nộp tiền.

• Trong trường hợp hệ thống chưa kịp đồng bộ dữ liệu (đã kê khai trên website nhưng ứng dụng eTax chưa hiện số tiền thuế), NNT nên thực hiện nộp tiền trực tiếp trên website để đảm bảo đúng thời hạn quy định.

>> Tìm hiểu thêm: Hướng dẫn nộp thuế điện tử cho hộ kinh doanh.

NNT cần liên kết tài khoản ngân hàng để nộp thuế trên eTax Mobile (Nguồn: Internet)

3. Các lỗi thường gặp khi nộp thuế điện tử qua eTax

3.1. Lỗi không đăng nhập được hệ thống eTax

Nguyên nhân có thể là do NNT nhập sai mật khẩu, gõ tiếng Việt có dấu, bị khóa tài khoản hoặc trình duyệt không tương thích với Java/eSigner. NNT cần tắt bộ gõ Unikey, kiểm tra phím caps lock, sử dụng trình duyệt Google Chrome/Edge đã cài eSigner hoặc dùng tính năng “Quên mật khẩu” để lấy lại mật khẩu mới qua email.

3.2. Lỗi không ký điện tử được tờ khai

Nguyên nhân thường do chữ ký số bị lỗi. NNT cần kiểm tra kết nối thiết bị, đảm bảo USB Token đã nhận trên máy tính, tải và cài đặt lại bộ eSigner bản mới nhất từ Cổng thông tin của Tổng cục Thuế và khởi động lại trình duyệt trước khi thực hiện ký.

3.3. Lỗi gửi tờ khai thất bại

Nguyên nhân có thể là do tệp hồ sơ không đúng định dạng XML, tên tệp chứa ký tự có dấu hoặc hệ thống của Tổng cục Thuế bị quá tải vào kỳ quyết toán. NNT cần xuất lại tờ khai, đặt tên file không dấu và thực hiện nộp lại vào các khung giờ thấp điểm để tránh nghẽn mạng.

3.4. Lỗi trùng kỳ kê khai hoặc đã nộp nhưng vẫn hiện chưa nộp

Nguyên nhân do NNT nộp nhầm tờ khai chính thức nhiều lần cho cùng một kỳ hoặc hệ thống thuế cập nhật trạng thái chậm (thời gian cập nhật dữ liệu khoảng 24 - 48 giờ sau khi nộp).

• Nếu sai số liệu: NNT lập tờ khai bổ sung để điều chỉnh và nộp đủ số tiền thuế thiếu, tiền chậm nộp (nếu có).

• Nếu sai sót về hóa đơn: NNT phải thực hiện thông báo với cơ quan thuế theo Mẫu số 04/SS-HĐĐT về việc hủy hoặc điều chỉnh hóa đơn điện tử đã lập có sai sót và lập hóa đơn mới thay thế theo đúng quy định.

Khi nộp thuế điện tử, NNT có thể gặp một số lỗi liên quan đến thao tác hoặc hệ thống, cần biết cách xử lý kịp thời để tránh trễ hạn thực hiện nghĩa vụ thuế (Nguồn: Internet)

4. Tổng hợp 04 lưu ý để nộp thuế online cho bán hàng online thành công

Để quá trình thực hiện nghĩa vụ thuế diễn ra thuận lợi và tránh các rủi ro pháp lý không đáng có, người nộp thuế (NNT) kinh doanh thương mại điện tử cần quan tâm đến các nội dung sau:

• Chú ý thời hạn kê khai - nộp thuế: NNT cần nắm rõ lịch nộp tờ khai và tiền thuế (thường là ngày 20 hàng tháng hoặc ngày cuối cùng của tháng đầu quý tiếp theo) để tránh tình trạng chậm trễ dẫn đến bị khóa mã số thuế.

• Mức phạt chậm nộp thuế: Việc chậm nộp tờ khai và tiền thuế sẽ bị xử phạt hành chính nghiêm trọng theo quy định tại Nghị định 310/2025/NĐ-CP, với mức phạt tiền từ 2.000.000 đồng trở lên tùy thời gian vi phạm.

• Đồng bộ dữ liệu bán hàng đa kênh: Khi kinh doanh trên nhiều nền tảng số hoặc sàn TMĐT, NNT cần tập hợp dữ liệu doanh thu về một đầu mối duy nhất để đảm bảo số liệu kê khai khớp đúng với dòng tiền thực tế, phục vụ công tác đối soát của cơ quan thuế.

• Kiểm tra kỹ tờ khai thuế trước khi gửi: NNT nên rà soát lại các chỉ tiêu về doanh thu, mã số thuế và kỳ tính thuế trên file XML trước khi ký số để hạn chế tối đa việc phải làm công văn hủy hoặc nộp tờ khai bổ sung phức tạp.

VNPAY đang triển khai chương trình miễn phí trọn bộ giải pháp Nộp thuế số đến hết năm 2028

5. Câu hỏi thường gặp

5.1. Shop online cần chuẩn bị gì trước khi nộp thuế điện tử?

NNT cần có mã số thuế, cá nhân/hộ kinh doanh, thiết bị ký số hoặc chữ ký số điện tử có giá trị pháp lý, và tài khoản đăng nhập hệ thống eTax. Đặc biệt, NNT bắt buộc phải thông báo bằng phương thức điện tử tất cả các số tài khoản ngân hàng và số hiệu ví điện tử liên quan đến hoạt động sản xuất, kinh doanh cho cơ quan thuế.

5.2. Bán hàng online doanh thu bao nhiêu phải nộp thuế?

Căn cứ Nghị định 68/2026/NĐ-CP, NNT có tổng doanh thu thực tế từ tất cả các kênh bán hàng trong năm dương lịch trên 500 triệu đồng thì bắt buộc phải kê khai và nộp thuế GTGT cùng thuế TNCN. Trường hợp doanh thu từ 500 triệu đồng trở xuống thì thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT và không phải nộp thuế TNCN.

5.3. Sàn TMĐT đã khấu trừ thuế thì có cần kê khai lại không?

Có. Mặc dù sàn TMĐT có chức năng thanh toán thực hiện khấu trừ và nộp thay, NNT vẫn phải thực hiện kê khai để tổng hợp lại toàn bộ doanh thu (bao gồm cả doanh thu ngoài sàn). 

Việc cơ quan thuế hỗ trợ tự động tạo lập tờ khai dựa trên dữ liệu từ sàn không thay thế trách nhiệm tự kê khai của NNT. NNT phải chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của thông tin này.

5.4. Shop kinh doanh trên sàn TMĐT quốc tế kê khai thuế như thế nào?

NNT thực hiện tự kê khai doanh thu, trong đó giá trị doanh thu tính bằng ngoại tệ phải được quy đổi ra Đồng Việt Nam theo tỷ giá giao dịch thực tế tại thời điểm phát sinh. 

Để được hưởng các điều kiện về khấu trừ hoặc xác định nghĩa vụ thuế đối với hàng xuất khẩu, NNT phải có đầy đủ: Hợp đồng ký với sàn, hóa đơn, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, tờ khai hải quan và các chứng từ vận đơn liên quan.

5.5. Cá nhân kinh doanh tiếp thị liên kết (affiliate) kê khai thuế như thế nào?

Thu nhập từ affiliate do các đơn vị chi trả khấu trừ tại nguồn là một phần của nghĩa vụ thuế. Tuy nhiên, nếu cá nhân kinh doanh có tổng thu nhập từ hoạt động này và các hoạt động kinh doanh khác đạt mức trên 500 triệu đồng/năm, cá nhân đó phải thực hiện khai thuế và quyết toán thuế TNCN theo quy định dành cho CNKD.

5.6. Nộp thừa thuế thì có lấy lại được không?

Có. Trường hợp NNT có số tiền thuế, tiền chậm nộp hoặc tiền phạt đã nộp lớn hơn số phải nộp thực tế trong năm hoặc đã bị khấu trừ thuế nhưng doanh thu cả năm từ 500 triệu đồng trở xuống, NNT được thực hiện thủ tục bù trừ, hoàn trả hoặc hoàn trả kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước theo quy định của pháp luật quản lý thuế.

Hồ sơ đề nghị xử lý tiền thuế nộp thừa được gửi đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp thông qua hệ thống eTax.

Các chủ shop online cần tìm hiểu kỹ những quy định về quản lý thuế mới 2026 để thực hiện đúng nghĩa vụ thuế (Nguồn: Internet)

Trong bối cảnh thuế số hiện nay, cá nhân và hộ kinh doanh online cần nắm vững quy trình nộp thuế điện tử cho shop online để chủ động phòng tránh các khoản phạt chậm nộp hoặc rủi ro bị khóa mã số thuế từ cơ quan chức năng. Việc thực hiện đúng các hướng dẫn kê khai trên hệ thống eTax vừa giúp NNT đảm bảo tính pháp lý, vừa hỗ trợ quản lý doanh thu đa kênh chuyên nghiệp và bền vững.

Hãy liên hệ trực tiếp với VNPAY qua các kênh dưới đây để nhận tư vấn chuyên sâu và hỗ trợ triển khai trọn bộ giải pháp nộp thuế số tối ưu:

• Hotline: *3388 

• Email: hotro@vnpay.vn

• Đăng ký tư vấn: Tại đây

*Thông tin mang tính tham khảo, hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh và doanh nghiệp nên tra cứu các văn bản pháp luật mới nhất hoặc liên hệ cơ quan thuế để áp dụng đúng quy định.